Patrijaršijski Upravni Odbor – Vrhovna izvršna (upravna i nadzorna) vlast nad crkveno-samoupravnim organima. Ovo telo sačinjava patrijarh kao predsedavajući, dva člana Svetog Sinoda, jedan predstavnik manastira, tri sveštenika i sedam svetovnih članova – laika. Sveti Sinod imenuje dva člana iz svog sastava, a ostale članove imenuje na šest godina. Ovo telo objavljuje i izvršava uredbe i odluke Svetog Sinoda, a nadzire samoupravne crkvene organe u njihovom radu, upravlja fondovima, zadužbinama i dobrima. Osim toga, kao upravna vlast predlaže budžet i priprema završni račun opštih rashoda i prihoda, stara se da sve crkve i manastiri imaju uredne zakonske dokaze za svoja dobra, konačno rešava o otuđenju i zaduženju nepokretnih crkvenih imanja, propisuje poslovnike za svoj rad, odobrava budžete, odobrava osnivanje fondova i bira činovnike i službenike za rad u ovom telu.
Pri PUO postoji upravna kancelarija koja vodi upravne poslove crkvene samouprave. Kancelarija ima tri odeljenja: opšte, ekonomsko i finansijsko.